Фундаментальные исследованияrae.ru
Научный журнал

Фундаментальные исследования

ISSN 1812-7339«Перечень» ВАКИФ РИНЦ = 1,798

ОДИНОЧНЫЕ АМИНОКИСЛОТНЫЕ ЗАМЕНЫ В МОЛЕКУЛЕ ГЕМАГГЛЮТИНИНА ШТАММОВ ЖИВОЙ ГРИППОЗНОЙ ВАКЦИНЫ, ПОДГОТОВЛЕННЫХ В РАЗНЫХ СУБСТРАТАХ, И ИХ ВЛИЯНИЕ НА ИММУНОГЕННОСТЬ (ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ДАННЫЕ)

Федорова Е.А. 1, Киселева И.В. 1, Исакова-Сивак И.Н. 1, Дубровина И.А. 1, Руденко Л.Г. 1
1ФГБУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины» Северо-Западного отделения Российской академии медицинских наук

Вакцинопрофилактика является наиболее эффективным, безопасным и экономически обоснованным средством борьбы с гриппом. В качестве приоритетного средства профилактики гриппа ВОЗ рекомендует живую гриппозную вакцину (ЖГВ) [14].

Формальным требованием, предъявляемым к гриппозным вакцинам, являются показатели прироста сывороточных антител. Состав внутренних генов вакцинных штаммов ЖГВ постоянен, поэтому основное влияние на иммуногенность вакцинного штамма оказывают свойства гемагглютинина (HA) и нейраминидазы (NA) эпидемического вируса.

Существуют два основных субстрата, в которых производится культивирование вируса гриппа и получение вакцинных штаммов: развивающиеся куриные эмбрионы (РКЭ) и перевиваемые клеточные линии [8, 11]. Мутации, появляющиеся в поверхностных антигенах вирусов гриппа в процессе адаптации к субстрату, могут оказывать влияние на иммуногенность вакцинного штамма, поэтому исследования одиночных мутаций в молекуле НА штаммов, культивируемых в разных биологических системах, могут помочь в выборе вакцинного кандидата.

Целью исследования было изучение аминокислотного состава НА штаммов ЖГВ, подготовленных на основе вируса гриппа А/Новая Каледония/20/99 (H1N1) в разных биологических субстратах (РКЭ, культура клеток MDCK) и определение их иммуногенности в экспериментах на животных.

Материалы и методы исследования

В работе были использованы полученные из ВОЗ два варианта «дикого» вируса А/Новая Каледония/20/99 (А/NC), выделенные в РКЭ и культуре клеток MDCK, и 4 их реассортанта с донором аттенуации отечественной ЖГВ А/Ленинград/134/17/57 (H2N2), (табл. 1). Реассортанты были подготовлены в отделе вирусологии ФГБУ «НИИЭМ» СЗО РАМН.

Таблица 1

Перечень использованных в экспериментах реассортантных штаммов

Название штамма

Система, в которой изолирован «дикий» родительский вирус

Система, в которой получен реассортант

Автор штамма

25М/1

MDCK1

MDCK

Киселева И.В. [12]

39Е/2

РКЭ2

MDCK

Киселева И.В. [12]

NC1453

РКЭ2

РКЭ

Киселева И.В. [1]

NC84

РКЭ4

РКЭ

Федорова Е.А.4

Примечания: 1№ последовательности HA ISDNAU0001 [7]. 2№ последовательности гемагглютинина AJ344014 [7]. 3Штамм коммерческой ЖГВ A/17/Новая Каледония/99/145. 4Клонированный вариант А/NC. 4Не опубликовано.

Секвенирование последовательности сегментов генома осуществляли с использованием автоматического капиллярного секвенатора 3130x Genetic Analyzer (Applied Biosystems). Последующая обработка данных производилась с использованием пакета программ Lasergene 7.1 (DNAstar). Моделирование пространственной структуры молекул белков проводилось с использованием сервиса SWISS-MODEL [10], Swiss-PdbViewer 4.1.0 и сервиса ZDOCK [13].

В работе использовались морские свинки (самки–альбиносы) весом 300–350 г, полученные из ФГУП «Питомник лабораторных животных «Рапполово» РАМН. Работа с животными проводилась в соответствии с «Правилами лабораторной практики» (Приказ МЗРФ № 708н от 23.08.2010).

Для исследования иммуногенности разных штаммов вируса гриппа морских свинок заражали интраназально в дозе 5 lg ЭИД50 на одну особь. Забор крови и назальных смывов производили через 2, 4 и 8 недель после заражения. В сыворотках определяли содержание вируссспецифических антител к штамму А/NC методами РТГА, микронейтрализации, содержание IgG методом ИФА, в смывах – содержание IgA методом ИФА.

Результаты исследования и их обсуждение

Для изучения состава гетерогенной популяции «дикого» вируса было проведено клонирование «яичного» варианта с последующим секвенированием сегмента генома, кодирующего НА полученных клонов (табл. 2). Также было проведено секвенирование последовательности HA и NA реассортантов, перечисленных в табл. 1. Последовательность сегмента генома, кодирующего нейраминидазу изученных штаммов, не отличалась.

Таблица 2

Отличия в аминокислотной последовательности гемагглютинина вакцинных штаммов на основе вируса гриппа А/NC

Позиция аминокислоты1

Локализация мутации в молекуле НА

Гетерогенность в исходной популяции

Штаммы

25М/1

39Е/2

NC145

NC84

78

Глобулярная часть HA1

Glu/Lys

Glu

Glu

Glu

Lys

131

Thr

Thr

Ile

Thr

Thr

190

Asp/Asn

Asn

Asp

Asp

Asn

225

Asp/Gly

Gly

Asn

Gly

Asp

436 (HA2 106)

Ножка НА2

Arg/Lys

Arg

Arg

Lys

Arg

442 (HA2 112)

Asp

Asn

Asp

Asp

Asp

Примечание. 1 Позиции аминокислот указаны в H3-нумерации.

В HA1 вариабельность была обнаружена в четырех аминокислотных позициях – 78, 131, 190 и 225. Еще две вариабельные позиции располагались в ножке гемагглютинина (аминокислотные остатки 106 и 112) (табл. 2). Аминокислотные позиции, по которым была выявлена гетерогенность, были визуализированы с использованием компьютерного моделирования (рисунок).

pic_53.tif

Расположение вариабельных аминокислотных остатков в молекуле гемагглютинина А/NC. На одном из мономеров показано расположение вариабельных аминокислотных остатков. Разными цветами показано расположение антигенных сайтов Ca, Cb, Sb, Sa [7]. Слева – вид со стороны одного из мономеров. Справа – один из мономеров показан в виде схемы основных элементов структуры, чтобы продемонстрировать аминокислотные позиции 106 и 112 в субъединице HA2, расположенные в центре тримера. Иллюстрация получена с использованием программы RasMol 2.7.5

Варианты вируса, выделенные в разных субстратах, отличались аминокислотной позицией 190: у MDCK-варианта в данной позиции располагается остаток Asn190, у РКЭ-варианта – Asp190 . Замена Asn190 → Asp190 описана в литературе как адаптационная к куриным эмбрионам: изменяется распределение заряда и способность к взаимодействию с рецептором с α-2,3 связью [5]. Реассортанты, подготовленные на основе вирусов, выделенных в разных субстратах, сохраняли аминокислотный остаток в позиции 190: штамм 25М/1 содержал Asn190, штаммы 39Е/2 и NC145 – Asp190. При клонировании «дикого» вируса в РКЭ нам удалось выделить компонент популяции, содержавший Asn190. Данный чистый клон был использован для подготовки вакцинного штамма NC84, и Asn190 сохранился после 6 пассажей в куриных эмбрионах. Это говорит о том, что влияние субстрата не однозначно определяет появление аминокислотной замены, но значительно повышает вероятность отбора субстрат-адаптированных вариантов. Это можно использовать при подготовке штаммов ЖГВ: предварительное клонирование и выбор клона может обеспечить более предсказуемый результат.

Наибольшие различия по показателям иммунного ответа были обнаружены между штаммами, подготовленными в культуре клеток MDCK (25M/1 и 39Е/2) и подготовленными в РКЭ (NC145, NC84) (табл. 3). Значения титров антител были наиболее низкими у штамма 25M/1: средние значения титров антител у животных, вакцинированных штаммом 25М/1, статистически достоверно отличались от значений титров антител в сыворотках животных, вакцинированных штаммами NC145 и NC84, на всех сроках, по результатам всех исследований. Штамм 39Е/2 был более иммуногенен, значения титров антител в данной группе статистически достоверно превышали титры, полученные в результате вакцинации 25М/1, на сроке 8 недель по результатам исследований сывороток тремя методами. Штаммы NC145 и NC84 вызывали статистически достоверно более высокие приросты титров антител, чем штаммы 25M/1 и 39Е/2. Между группами NC145 и NC84 статистически значимых различий обнаружено не было.

Две вариабельные позиции в НА1 не оказали значительного влияния на иммуногенность: это гетерогенная позиция 78 (табл. 2), относящаяся к антигенному сайту Cb [7], и позиция 225, расположенная в петле 220 рецептор-связывающего кармана. 225 позиция, по данным литературы, является вариабельной среди вирусов подтипа H1 [3].

Таблица 3

Среднегеометрические титры антител против вируса гриппа А/NC в сыворотках и назальных смывах морских свинок

Препарат

Метод учета

Срок после вакцинации, недели

Метод учета

Срок после вакцинации, недели

2

4

8

2

4

8

25M/1

РТГА, сыворотки

5,0

9,6

12,9

ИФА IgG3, сыворотки

72,5

262,5

951,0

39E/2

5,0

10,0

29,7

390,1

1159,3

2826,5

NC145

13,5

65,6

144,9

7608,3

20480,0

22611,8

NC84

15,9

40,0

80,0

6450,8

10240,0

16255,0

Плацебо

< 10

< 10

< 10

< 10

< 10

< 10

Н1

22,29

11,01

13,39

20,99

19,15

20,14

р2

0,0001

0,0117

0,0039

0,0001

0,0003

0,0002

25M/1

РМН, сыворотки

10,0

16,4

40,0

ИФА IgA, смывы4

< 2

< 2

< 2

39E/2

10,0

26,9

215,3

2,5

2,0

1,6

NC145

195,0

2100,0

5120,0

12,6

32,0

20,0

NC84

50,4

1015,9

2031,9

8,0

10,1

6,3

Плацебо

< 10

< 10

< 10

< 2

< 2

< 2

Н

22,90

20,91

21,70

4,21

5,93

6,12

р

0,0001

0,0001

0,0001

0,2362

0,1152

0,1050

Примечания:

1 значение критерия Краскела – Уоллеса.

2 уровень статистической значимости;

3 определение содержания сывороточных иммуноглобулинов класса G методом ИФА;

4 определение содержания иммуноглобулинов класса А в назальных смывах методом ИФА.

Штамм 39Е/2 за счет замены Thr131 → Ile131 в НА1 потерял потенциальный сайт гликозилирования. Подобная замена описана в исследовании [4] как влияющая на способность НА вируса к связыванию с рецептором. Возможно, именно это стало причиной сниженной иммуногенности данного реассортанта, поскольку по остальным позициям 39E/2 не отличается от более иммуногенных штаммов на основе А/NC.

Среди исследованных нами штаммов были два варианта, содержавшие уникальные замены в НА2 – NC145 и 25M/1. Штамм NC145, обладавший наиболее высокой иммуногенностью по показателям гуморального иммунного ответа, содержал Lys106 в НА2, у остальных исследованных штаммов в данной позиции располагается остаток Arg106. Гетерогенность Arg/Lys в данной позиции характерна для H1-вирусов [15]. Позиция 106 располагается в области оси симметрии тримера HA, в непосредственной близости от пептида слияния, в точке, где длинный α-спиральный участок подвергается анфолдингу при низких pH [2]. Остаток Lys106 формирует водородные связи с Glu103 и взаимодействует с анионами, что стабилизирует структуру в области оси тримера. Arg106 формирует солевые мостики с Glu105, но ионные взаимодействия в области оси тримера значительно слабее [6]. Возможно, Lys106 стабилизировал структуру НА штамма NC145, что и привело к его наибольшей иммуногенности среди исследованных штаммов.

Замена Asp112 → Asn112 в HA2 была обнаружена у штамма 25М/1, обладавшего самой низкой иммуногенностью среди исследованных штаммов, а также сниженными показателями репродукции в развивающихся куриных эмбрионах. По данным литературы, Asp112 формирует 4 водородных связи, стабилизирующих пептид слияния, и мутации в этой позиции приводят к изменению конформации при менее кислых pH [9]. Вероятно, данная мутация изменила свойства НА штамма 25М/1, что привело к более низкой иммуногенности.

Заключение

Вакцинные штаммы на основе вируса гриппа А/Новая Каледония/20/99 (H1N1), содержавшие отдельные аминокислотные замены в НА, обладали разной иммуногенностью по показателям гуморального иммунного ответа в эксперименте на морских свинках. Наиболее высокие показатели гуморального иммунного ответа были достигнуты после иммунизации штаммами, подготовленными в развивающихся куриных эмбрионах. Штаммы, подготовленные в культуре клеток, приобрели уникальные аминокислотные замены в гемагглютинине и вызывали гуморальный иммунный ответ меньшей степени выраженности.

Работа выполнена при поддержке гранта № 14–15–00034 Российского Научного Фонда (Москва, Россия).

Рецензенты:

Жилинская И.Н., д.б.н., ФГБУ «НИИ гриппа» МЗ РФ, г. Санкт-Петербург;

Рябчикова Е.И., д.б.н., профессор, ФГБУН «Институт химической биологии и фундаментальной медицины» СО РАН, г. Новосибирск.

Работа поступила в редакцию 27.10.2014.


Библиографическая ссылка

Федорова Е.А., Киселева И.В., Исакова-Сивак И.Н., Дубровина И.А., Руденко Л.Г. ОДИНОЧНЫЕ АМИНОКИСЛОТНЫЕ ЗАМЕНЫ В МОЛЕКУЛЕ ГЕМАГГЛЮТИНИНА ШТАММОВ ЖИВОЙ ГРИППОЗНОЙ ВАКЦИНЫ, ПОДГОТОВЛЕННЫХ В РАЗНЫХ СУБСТРАТАХ, И ИХ ВЛИЯНИЕ НА ИММУНОГЕННОСТЬ (ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ДАННЫЕ) // Фундаментальные исследования. 2014. № 11. С. 1311-1315;
URL: https://www.fundamental-research.ru/article/view?id=35721 (дата обращения: 23.08.2026).